Type de séminaire
Séminaire
Titre
Thomas Bourquard - Exploitation des algorithmes génétiques pour la prediction de structures complexes protéine-protéine
Lieu
Campus - Amphi MJK
Organisateur
Alexandre Termier
Intervenant
Thomas Bourquard, LRI (Paris XI)
Date
04/03/2010
Heure
14:00
Information détaillée
Résumé

Les fonctions de la majorité des protéines sont subordonnées à l’interaction avec un ou plusieurs partenaires : petites molécules, autres protéines, acides nucléiques etc... complexes impliqués dans de nombreux processus cellulaires. La plupart de ces interactions sont transitoires, elles sont difficiles à détecter expérimentalement et l’obtention de la structure d’un complexe est généralement impossible. C’est pourquoi la prédiction in silico de l’existence de ces interactions et la structure du complexe résultant ont été l’objet de nombreuses études depuis plus d’une décennie maintenant. Pour autant les protéines sont des objets complexes et les méthodes informatiques classiques sont trop « gourmandes » en temps pour l’exploration à grande échelle de l’interactome des différents organismes. Dans ce contexte de développement d’une méthode de docking protéine-protéine haut débit nous présenterons ici l’implémentation d’une nouvelle méthode exploitant les algorithmes génétiques pour la prédiction d’interaction de structures simplifiées par utilisation de la tesselation de Voronoi.

Mots clés
Calcul pour les sciences et technologies
Intelligence Artificielle
Interrogation de données, Masses de données
Systèmes informatiques






Langues du site

ou d'autres langues
via la passerelleAXiMAG...






Suivez le LIG sur Twitter


UMR 5217 - Laboratoire LIG - Maison Jean Kuntzmann - 110 av. de la Chimie - Domaine Universitaire de Saint-Martin-d’Hères - BP 53 - 38041 Grenoble cedex 9 - France
Tél. : +33 (0)4 76 51 43 61 - Fax : +33 (0)4 76 51 49 85
CNRS Grenoble INP INRIA UJF UPMF Université Stendhal